A Gerência de Pesquisa – GERPE da Diretoria de Inovação, Ensino e Pesquisa – DIEP é responsável pela gestão do Centro de Pesquisa Clínica do IGESDF, tendo como objetivos principais e finalidade a promoção e o desenvolvimento da pesquisa científica na instituição, bem como a regulamentação e disseminação dos fluxos de submissão de projetos de pesquisa e orientação, suporte e monitoramento das pesquisas realizadas no IGESDF.

Atualmente, a Gerência de Pesquisa é composta por dois núcleos:

Núcleo de Apoio ao Pesquisador (NAPES);

Núcleo de Pesquisa Clínica (NUPEC).